- Centrum Badań Naukowych Chorób Klatki Piersiowej
- Centrum Języków Specjalistycznych w Medycynie
- Uniwersyteckie Centrum Wsparcia Badań Klinicznych
- Centrum Kształcenia w Języku Angielskim Collegium Medicum UMK
- Centrum Przedsiębiorczości Akademickiej i Transferu Technologii (CPATT)
- Centrum Symulacji Medycznych Collegium Medicum UMK
- Centrum Komunikacji Klinicznej
- Studium Wychowania Fizycznego i Sportu CM
- Samodzielne Stanowisko ds. Doświadczeń na Zwierzętach
- Komisja Bioetyczna
